期刊简介

               中华医学会主办,四川大学承办。本刊以报道我国医学遗传学、人类遗传学和相关领域的基础理论、技术方法等最新研究成果;以从事医学遗传学工作的各科临床医生、计划生育工作者、大专院校和科研单位有关人员为主要读者对象。设有述评、论著、技术与方法、综述、调查报告、遗传咨询、临床细胞遗传学、病例报告等栏目。 从1998年以来被美国《医学索引》(IM)、《化学文摘》(CA)、《工程索引》(EI)、ISI数据库的Biological Abstracts及BIOSIS Previews,波兰《哥白尼索引》(IC),荷兰《医学文摘》(EM)和俄罗斯《文摘杂志》(AJ)等国际著名检索系统收录。                

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  • 杂志名称:中华医学遗传学杂志
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中华医学会
  • 国际刊号:1003-9406
  • 国内刊号:51-1374/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:2000年获四川省优秀期刊一等奖期刊收录:CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 万方收录(中), 文摘与引文数据库, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 维普收录(中), 剑桥科学文摘, 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), Pж(AJ) 文摘杂志(俄), 文摘杂志, 哥白尼索引(波兰), 医学文摘, CA 化学文摘(美)
中华医学遗传学杂志2015年第06期

用等位基因特异性PCR/限制性片段长度多态性策略构建原发性青光眼致病基因CYP1B1的单倍型

张爱平;李圣杰;欧阳琦;汤荔;王晓蕾;吉建;曹文俊

关键词:原发性先天性青光眼, CYP1B1基因, 单核苷酸多态性, 等位基因特异性PCR/限制性片段长度多态性, 单倍型
摘要:目的 建立等位基因特异性PCR/限制性片段长度多态性(allele-specific PCR/restriction fragment length polymorphism,AS-PCR/RFLP)法检测原发性先天性青光眼(primary congenital glaucoma,PCG)致病基因CYP1B1常见单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)及其单倍型的方法.方法 收集20例原发性先天性青光眼患者和20名正常对照为研究对象,首先经测序筛查SNP位点后,再分别以PCR-RFLP和AS-PCR/RFLP策略构建CYP1B1基因rs10012(S1)和rs1056827(S2)及rs1056836(S3)和rs1056837(S4)位点的单倍型,并对这两种策略进行评价.结果 测序共发现4个SNP位点,为第2外显子rs10012 G/C(S1)及rs1056827 T/G (S2)、第3外显子rs1056836C/G(S3)及rs1056837T/C(S4).这些位点在PCG患者和正常对照中的分布呈现不同特点,同时存在rs10012 (S1)和rs1056827(S2)位点的PCG患者和正常对照分别为10例(50%)和5人(25%);同时存在rs1056836 (S3)和rs1056837(S4)位点的PCG患者和正常对照分别为5例(25%)和2人(10%);均未发现上述SNP位点单独存在.确定各位点的分布特点后,首先用PCR-RFLP策略构建rs10012(S1)和rs1056827(S2)位点单倍型,显示杂合突变型除出现目的条带外还存在底物条带,虽提示同时存在rs10012(S1)和rs1056827 (S2),但仍不能证实存在位点间的连锁;AS-PCR/RFLP构建的结果显示,AS-PCR扩增rs10012(S1)位点获得阳性结果的同时,针对rs1056827 (S2)位点的特异性RFLP分析也获得阳性结果.AS-PCR/RFLP对位点rs1056836(S3)和rs1056837 (S4)的分析获得了类似的结果.应用AS-PCR/RFLP成功构建了C-G[rs10012(S1)-rs1056827(S2)]和G-C[rs1056836 (S3)-rs1056837 (S4)]两种单倍型.结论 应用AS-PCR/RFLP策略成功构建PCG致病基因CYP1B1单倍型,该方法准确高效特异可用于构建遗传性疾病基因的单倍型.